负责对阿勒泰市传染病防治、公共场所卫生、饮水卫生、学校卫生、职业卫生等相关公共卫生实施监督管理。研究监测各类与人群健康密切相关的重大危险、致病因素。
负责制定阿勒泰市当地卫生人才发展规划；指导、组织开展卫生专业技术职务聘任和任职资格认证的有关工作；负责制定卫生从业人员继续教育和有关专业培养计划和方案，并组织实施。
负责阿勒泰市当地突发公共卫生事件和涉及卫生的突发公共事件的应急管理工作；负责建立阿勒泰市当地院前急救系统和医疗救治系统，组织开展应急医疗救护工作。
负责制订阿勒泰市当地卫生科技发展规划，组织阿勒泰市当地重大卫生问题研究和重点科研项目攻关，并指导科技成果的转化和推广；负责阿勒泰市当地与人群健康有关的实验室及其实验活动的生物安全监督工作。
