组织、协调和参与管理新疆公路、水路交通行业利用外资工作，开展对外交流与合作工作。
制定新疆交通行业科技政策，组织重大交通科技项目攻关，指导交通运输信息化建设。指导、监督交通行业技术标准和规范的实施，指导公路、水路行业环境保护和节能减排工作。
指导新疆公路、水路行业安全生产和应急管理工作，组织实施重点物资和紧急客货运输，负责新疆高速公路及重点干线路网运行监测和协调，参与公路、水路有关交通战备工作。
承担新疆公路、水路、地方铁路建设市场监管责任。组织协调公路、水路、地方铁路有关重点工程建设和工程质量、安全生产及造价的监督管理工作，指导交通运输基础设施管理和维护，承担有关重要设施的管理和维护。
